2599年，人类酝酿了五百年之久的火星移民方案终于要迈出重要一步了。在此之前，科学家通过向火星投进藻类以及甲由以改进火星的生存环境。而今，为了避免死刑的赏罚，小町小吉（伊藤英明 饰）和两小无猜秋田奈奈绪（武井咲 饰）不得不答应本多博士（小栗旬 饰）的要求，与武藤仁（山下智久 饰）、蛭间一郎（山田孝之 饰）、森木明日香（菊地凛子 饰）、堂岛启介（加藤雅也 饰）等有着不同身份和背景的人们踏入前往火星的飞船。抵达意图地后，他们惊奇地发现甲由早已进化成无比健硕巨大的生物，并且敏捷向他们发起了进攻。　　在战役过程中，他们了解到这次火星游览的真正意图，于是为了回到地球而拼尽全力与洪水般的甲由人战役……