1991年，香港黑帮三合会会员刘健明遵从老大韩琛的吩咐，加入差人部队成为黑帮卧底，韩琛许诺刘健明会帮其在七年后晋升为见习督察。1992年，差人练习校园优异学员陈永仁被上级要求深化到三合会做卧底，终极目标是成为韩琛身边的红人。2002年，两人都不负重望，也都身背重压，刘健明渐想成为一个真实的好人，陈永仁则盼着尽快回归差人身份。 重案组从陈永仁手中获悉一批毒品买卖情报，锁紧目标人物韩琛，没料情报被刘健明泄出，两边举动均告失败。但此事将两边均有卧底的事实暴露，引发两边高层铲除内鬼的决心。命运迥异又类似的刘健明和陈永仁开端在无间道的旅程中承受严峻考验。