李时珍（林文龙 饰）自在沉迷于草药研究之中，他同名为吴慕榕（李诗韵 饰）的女子先前已有婚约，却无法自我克制的爱上了善良美丽的阿冬（叶璇 饰）。李时珍决定将这份爱情埋藏在心底，待科举考试之后向阿冬表白心意，哪知道在阴差阳错之中，他不只没可以表白，还娶了吴慕榕为妻。　　李时珍发现当今世上的医书过错连连漏洞百出，所以起了撰写《本草纲目》的念头。然而，他却由于个性过于耿直而开罪了权贵，使得他不得不暂时中断了医书的撰写，还性命不保踏上了逃亡的旅途。所幸有太医院的庞宪（马国明 饰）一路帮助扶持，李时珍总算完成了旷世奇作《本草纲目》。