位于东京西部的巨大“学园都市”。　　在总人口达230万人，其中约8成是学生的这座都市中，施行着超才能开发的特别课程，学生们的才能被给予从“无才能Level 0”到“超才能Level 5”的六阶段评价。　　在这样的学园都市君临才能者顶点的最强才能者·一方通行。他在仅有7人的“超才能者”傍边也以远超其他人的才能位居榜首，也因为这种力量而过着充满杀伐的日常。不断重复、脱离常轨的“实验”，以及在寻求绝对力量的最终品尝到的败北。在那之后，随着与一位少女——最终之作的相遇，他的命运产生了巨大变化。　　最强而最凶的“恶”——一方通行，　　扫平学园都市的“漆黑”!!