草薙素子之后，巴特与侦察身世的陀古萨结为伙伴。近期发生多起机器人偶杀害主人继而自杀的事情，因为受害者家族均无公诉，且死者中有政客与公安官员，于是公安9课派出巴特小组查询此案。杀人人偶皆为荒芜地带公司出品的哈德莉机型，应部分顾客要求，该机型一起具备异性玩伴的功用，巴特从荒芜地带公司出货官遇害入手，卷入与黑帮的战斗，期间有人侵略他的大脑，使其自残。　　巴特决定直奔荒芜地带总部，他与陀古萨拜访了择捉岛上的黑客基姆，后者布下体系陷阱，幸有素子提出正告防止陀古萨陷入控制。依靠基姆这条线索，巴特登上了荒芜地带公司设立在海上的工厂船，素子再次降临他的身边，与其并肩作战。