圣诞之夜，卡森共和国水企业和哈里曼达拉公司签订协议的大厦门外，无数大众声讨抗议。而就在此刻，担任护卫的警察机动部队突然掏枪对示威大众展开无差别残杀。血腥恐怖的事情背后，神秘病毒“火种”若有若无。在与不明敌人对决过程中，草薙素子（坂本真绫 配音）和独立机动部队的伙伴们救下了全身义体的少女津田艾玛（茅野爱衣 配音），其身上好像隐藏着使用虚拟回忆进行恐怖活动的事实。公安9课课长荒卷大辅（塾一久 配音）回绝将其交给陆军情报部穗积上校（庆长佑香 配音），而是指令草薙将艾玛护送至501机关承受查询。草薙在少女身上不只发现两个魂灵的存在，更接触到了被官方、军方可以隐藏的悲惨真相……　　本片依据士郎正宗的原作改编，为攻壳机动队前传“ARISE”的第四部。