故事发生在虚构的未来国际，彼时，人类由于忽略和粗心而失去了制海权，海洋，成为了人们可望而不可即的所在，盘踞在那里的，是一股名为“深海栖舰”的强大实力。为了同这股实力反抗，一群名为“舰娘”的女孩子们呈现了，在她们的体内，栖息着舰艇之魂，亦是明日呢化身成为各式各样的战舰，为了人类的和平做着不懈的尽力。　　素日里，舰娘们在名为“镇守府”的大本营里进行日常生活和练习，某日，一位名叫吹雪（上坂堇 配音）的活泼女孩呈现在了我们的面前，初来乍到的她踌躇满志，热情满满地加入了舰队的新生活中去，在这里，充满了精彩和刺激的日常就此打开。