故事发生在箱庭学园，黑神目泷（丰崎爱生 配音）是学园一年级的新生，作为校园里的学生会长，黑神拥有完美的外表，优异的成绩，强健的身体和丰盛的家底，如此完美的女神，在朝气蓬勃的校园里会遇见怎样风趣的故事呢？　　人吉善吉（小野友树 配音）是黑神的两小无猜，两人从小玩到大，彼此之间爱情十分要好。作为支持率百分之九十八的学生会长，黑神联手人吉善吉设置了“意见箱”，同老友阿久根尊贵（浪川大辅 配音）、喜界岛枫夏（芽野爱衣 配音）等人一起，解决校园中的各类疑难杂症。但是，随着黑神的势力越来越大，一些不友好的声响随之而来。