《战国BASARA》中活泼的武将们，在现代高中再次展开了剧烈的战斗：上一任学生会长“丰臣秀吉”遭到停学处置，学园内群雄割据，为抢夺新会长之位成为乱世。足球社的王牌“真田幸村”、棒球部的王牌“伊达政宗”，高呼着团结就是力量的“德川家康”，矢志打倒家康的“石田三成”等人纷纷参战——这个紊乱的学园，还会有明日吗？