2031年，因为作为次世代能量设备而开发的“量子反应堆”的暴走事故，世界剧变。忽然从地下蔓延的亮光，吞噬都市楼群、覆盖大地，终究，逾越、融合了生物、机械、植物的不知道特异进化生物“B.R.A.I”呈现了。　　7年后，翔龙重生为肯定防卫都市“新翔龙”。它以惊人的速度完成进化，并成为与陷人类于消亡危机的B.R.A.I相对立的人类最后的期望要塞。　　被命运所引导而集合在新翔龙的雷昂、可依、坤灵、道格。将他们迎入防卫军的塞西尔、凯恩、杰、格伦。于是，赌上人类存亡而战的特别部队“潘多拉”诞生了。　　契约之时，期望被托付给了他们——