4月2日，全新的游戏王动画始动！叙述18岁新主角集齐6（原五张）龙卡的全新故事！　 　　武藤游戏的年代数十年后的童实野町，演变成了阶级社会的未来都市——新童实野市。主人公不动游星驾驭着决战盘的进化型D轮摩托以从基层区到上层区为目标奔驰。　 　　以夺走对自己和朋友很重要的卡星尘龙的为所欲为的竞敌·骑乘决战的冠军人物杰克·阿特拉斯地点的决战竞技场为目标，终于游星和杰克坚持了。怀着各自的坚定信念的他俩的主力怪兽——星尘龙与真红魔龙打开激烈冲突！在二龙之战中遽然呈现的奥秘红龙，让游星的手臂浮现出了龙之印。由龙之印所引导的各自的命运在这一刻开始了。到底为朋友而战的游星前面等待着他的会是什么？龙之印所带来的到底又是什么呢？ 　　年代是游戏王GX后的几十年。 　　决战盘进化！骑乘决战大为盛行！ 　　在5D'S的年代，结合了摩托竞速与卡片游戏的竞技骑乘决战，以骑乘型最新决战盘D轮进行的高速感决战非常盛行，让观众也跟着狂热起来！新怪兽连续上台！新动画当然也是充满各种决战局面！ 　　从没见过的怪兽们正极度活跃之中。 　　游戏王5D’S的卡片也有所不同了： 　　新规则中白色同调怪兽卡追加！ 　　这次的新规则中添加了一种名为同调怪兽的白色卡片，能力：放在额外卡组，如果场上的对应协调怪兽和其他怪兽的等级合计与同步怪兽的等级吻合能够特别召唤。　　卫星区篇　　以武藤游戏地点年代数十年后的童实野市为舞台。那时的童实野市被称为“新童实野市”，是一个依据身份高低分为上层地带和基层地带的阶级社会，盛行着使用被称为“D轮（D Wheel）”的摩托车型决战盘决战的“骑乘决战（Riding Duel）”。　不动游星在新童实野市的基层地带“卫星区（Satellite）”中与伙伴们一起生活着。因被对手——骑乘决战的KING“杰克·亚特拉斯”偷走了自己最重要的卡“星尘龙（Stardust Dragon）”，为了把它夺回，游星逃出了卫星区。　　Duel of Fortune Cup篇　　再会后的游星与杰克在Stadium进行了骑乘决战。在白热化的战斗打开途中，两人的手臂忽然呈现了印记，最终伴随着两边的主力龙互相攻击，奥秘的红龙呈现了。得知此事的治安维持局长官雷克斯，将游星的伙伴捉走作为人质，强迫他参与优胜者能够取得向KING杰克的应战权的“Duel of Fortune Cup”大赛。在这个大赛里被雷克斯招引过来的游星、超能力决战者十六夜亚纪、天才决战少女龙可、还有杰克4人、都觉悟为“红龙的龙印者”，最终取得优胜的游星在与杰克的决战中取得了胜利，成为了新的决战王。　　暗印者篇　　原来Fortune Cup是歌得温为了集合龙印者所举行。另一方面，一群名为“暗印者”的决战者现已蠢蠢欲动，他们能够打开会令决战者遭到真实损伤的“漆黑决战”，以及使用一种叫“漆黑同步”的新战法，以及在背后操控他们的“地缚神”。游星以制作衔接卫星区和都市区的代达罗斯桥为条件，前往卫星区阻挠“暗印者”的方案。　　WRGP篇　　与“暗印者”之战半年后，衔接卫星区和都市区的桥梁终于完成，彼此的界线总算消失。全市还制作了大量专为骑乘决战而设的高速公路，还开发了高速世界2取代以前的高速世界，世界大赛“WRGP”开幕在即，游星等人组成“5D'S队“参赛。然而，新的威胁现已悄悄地来临——奥秘组织“太一”的三皇帝呈现，使用能够吸收同步怪兽的“机皇帝”欲图消灭童实野市，市区上空不时浮现不祥的黑影。两边在大赛决战相遇，这场战斗的胜负将决议童实野市的存亡。　　弧线摇篮篇　　虽然阿波利亚被打败，带来消灭的黑影正体”弧线摇篮“还是呈现了，童实野市危在旦夕。而主使这一切的”Z-ONE（忘-我）“也终于浮出水面，来自被破灭未来的他要消灭灾害的肇源童实野市改动未来。游星等人不能认同他的做法，登上”弧线摇篮“与”Z-ONE“打开最终的决战。最终，Z-ONE被游星打败，弧线摇篮消失，游星拯救了童实野市，平安归来。　　后日谈　　Z-ONE被打败数年后游星等人的故事。　　副注　　现在看到的故事剧情是在Z-ONE介入改动前史后的状况。本来的前史到暗印者便是最终BOSS，没有WRGP存在。之后游星与伙伴参与各种世界大赛，在不断的磨炼中领会“CLEAR MIND”、加速同步、三角加速同步，成为将人类领向进化新年代的传奇人物。但在未来人类因为过快进化滥用同步而恶欲膨涨，招来消灭。Z-ONE为改动介入了曩昔改动了前史，故事才有了现在的状况。