骷髅人的故事设定在一个“架空的时代”的“架空的日本”中，故事舞台则是一个在被称为“影之都”的巨大企业支配下的闭锁都市舞台。因远古秘宝骷髅头盔而具有超能力的“反英豪”不知道主角在这个架空的舞台上，在正义与凶恶、光亮与黑暗、人类与非人类的纠葛之间穿梭。作为黑暗英豪，一切的怜悯与同情都是多余的。骷髅人并非是仁慈的正义英豪，在向他显露獠牙之前请考虑清楚。 骷髅人到底是谁？这是本著作的一个特征，不到最后时刻是不会揭示骷髅人的真面目的。或许是主角？或许是形似仁慈无能的神父？或许是大伴集团的骨干分子？或许是名不副实的警方？或许是路人A或供给情报者B？现在唯有等待动画中或许供给的头绪或一直看到最后……