地球上的人类的安危被来自冥王星的巨大陨石Tanatos(希腊神话)所威胁着。为了对立Tanatos，人类以国际太阳系开发组织“ISDA”为发足点，秘密进行着一贯不为人知的开发方案“D方案”，方案内容为利用在小笠原近海发现的迷之生命体“龙”进行生态兵器的开发，然后利用“龙”去直接损坏Tanatos，正在这个方案正在推进的一起，因事端在2年前失去家人的孤单少年与搭救他的迷之少女命运般的相遇了……有关谜之生命体“龙”是具有高智能以及超级攻击力的究极生命体。在小笠原冲深海发现的卵状况的“龙”被送往“ISDA”秘密的进行着培育..