《新世纪福音战士》电影版第1部。分为“DEATH篇(逝世篇)”与“REBIRTH篇(重生篇)”两个部分。“逝世篇”以原TV版动画第1集到第24集的内容为根底,重新编排了一个总结篇。“重生篇”内容接受第24集内容: 第十七使徒被消除后,SEELE向NERV下达指令,要EVA初号机负责执行“人类补完计划”。然而碇元度不认同SEELE的做法,拒绝执行。SEELE确定这是一种叛变的行为,决议把NERV彻底消除。 破晓时分,NERV本部忽然遭到来自战略自卫队的突击,他们对NERV的人员进行了惨无人道的大屠杀。为了维护驾驶员,葛城美里指令把精力崩溃的明日香送上二号机,并放在湖底的深处,自已就亲身去救碇真嗣 。但此时的碇真嗣现已处在精力崩溃的边缘。