《咕噜咕噜魔法阵》叙述了一个这样的故事：在吉姆吉姆大陆上的一个小村庄吉米拉村，有一天，国王颁布了勇者召集令赏格，假如有人可以消灭魔王将会得到五万R并且可以成为哥达国的王子。仁杰的父亲发现了召集令，为此训练他的儿子、逼迫儿子成为勇者踏上旅程。吉米拉村有着旅行前不得不去访问 魔法婆婆的规矩，按照这个规矩，仁杰抵达了魔法婆婆的家，勇者被命令和可以运用咕噜咕噜魔法的米古米古族人歌莉一同踏上旅程。然后被国王认同是勇者的仁杰以打倒妄图降服世界的魔王纪力而和歌莉开始了旅程。