就快放暑假了，小学生上原康一在放学回家的路上捡到一块大石头。他把石头带回了家，没想到用水一洗，里边竟跳出一只小河童来。小河童对他“咕”的叫了一声，于是康一就给它取名为“小咕”。　　小咕会说人类的言语，几百年来他一直被埋在在地下。康一很快就和小咕成了好朋友，他们一同洗澡，一同吃饭，一同睡觉。而其它家庭成员也接受了小咕，小河童成了上原一家的隐秘。　　一天，小咕提出想回家和伙伴们在一同。康一为了让小咕了解外面的世界，悄悄把它带了出去。小咕发现环境已经面目全非，大吃了一惊，这个不合适就河童生存的地方根本就找不到伙伴。看到小咕难过，康一也不好受。他和小咕一同外出游览，来到了还保存着河童传说的远野县。两人在美丽的大自然中找到了合适河童生活的地方，小咕愉快地在明澈的河里游了起来，康一也为它高兴。可是，在这里也怎样都找不到其它河童。康一听到乡民们说“抓住一只河童能得一千万呢！”，急忙带着小咕离开了那里。　　回到家，康一讶异地撞见了一个小报记者。原来那人听说上原家养着一只河童，一定要拍照。小咕的隐秘终于被我们知道了。康一的爸爸被公司勒令一定要让河童上电视。为了上原一家，小咕答应参与电视节目。然而在参与嘉宾里，它看到了一个长得很像杀父凶手的人。就在小咕被恐惧围住的时候，电视节目现场发生了意外。它拼命逃到了外面，然而无论跑到哪里都会看到黑压压的人群。　　为了摆脱让它惧怕的人类，小咕爬上了东京塔。夏季的烈日照得它精疲力竭。小咕俯瞰着城市，单独低语道：“哪里都找不到一个安静的地方，这里是人类的窝。我已经不行了。我要去爸爸那里……”