年幼的爱力克兄弟非常怀念去世的母亲，不吝冒犯炼金术中最大的忌讳，进行了人体炼成。但是炼成失利了，哥哥爱德华失去了左腿与右臂，弟弟阿尔冯斯失去了肉体，只能把灵魂附身在一副盔甲上。为了归还他们自己的罪，找回失去的一切，兄弟二人踏上了寻找传说中的“贤者之石”的旅程。　　几年后，一位右臂与左腿都是由“机械盔甲”代替的国家炼金术士出现在人们的眼前，他被称作“钢之炼金术师”。