时间是近未来，地点是日本。　　警察部队正在追捕古怪机器人带领的暴走集团，但在敌人的火力下，警方显得一触即溃。英勇应击的女警秋夏子名悬一线，幸亏被突然出现的奥秘女子救下。随后又有多起案子，相同是在警方束手无策时，奥秘女子出手处理事件。原来，这位奥秘女子是自称Cutie Honey具有魔法能力的正义兵士，她要面临的是相同具有魔法能力的 犯罪集团“番撒圣衣”的成员、四天王、及其首领希斯塔吉尔。为了防止日本被“番撒圣衣”损坏，Cuite Honey与《每朝早报》的记者早见青儿、女警秋夏子联合起来战役。而Cutie Honey的实在身世，则在与“番撒圣衣”的战役中，逐渐浮出水面。