平凡的中学生鹿目圆（悠木碧 配音）有一个圆满的家庭，在日子中她是个性情温柔又有爱心的好孩子。转学生晓美焰（斋藤千和 配音）的呈现打破了小圆平静的日子，这个性情酷酷又体弱多病的黑长直少女好像对小圆有着什么难言之隐。命运中的相遇呈现了，小圆在路旁边救下了一只浑身是伤的奇怪动物 ，没想到这只动物居然会说人类的言语。它告诉小圆它的名字叫丘比（加藤英美里 配音），而且提出了一个特殊的要求，它期望小圆能够和它签订契约成为魔法少女。　　魔法少女是这个世界中一种特殊的存在，她们肩负着和魔女战役的使命，作为报酬，丘比能够完成她们恣意的一个愿望。在战役的过程中，小圆发现魔法少女这个工作并非故事里所描绘的那么夸姣，随时有着献身的可能。而且，跟着战役的晋级，一个关乎于她自己的严酷真相正在逐渐的浮出水面。