“东京决战”一年后，布里塔尼亚少年鲁路修在11区（原日本国）过着平凡的学生生活。但是，鲁路修与弟弟罗洛的一次出行，遇到了黑色骑士团的余党。在与少女C.C再次结成契约之后，尘封的回忆摆在了鲁路修的面前。 　　身为帝国王子的鲁路修，为了建立人人平等的世界、让妹妹娜娜丽美好的世界，而运用GEASS，令人绝对遵守的力量，带领黑色骑士团向帝国宣战。带上假面化名ZERO的他，却在一年前的“东京决战”中被老友朱雀击败，被帝国皇帝抹去了回忆。 　　现在，康复回忆的鲁路修不仅要面临帝国的强壮军事力量，更要面临虚假的弟弟罗洛、失踪的妹妹娜娜丽、不知敌友的中华联盟、内部出现分歧的黑色骑士团。面临内忧外患，鲁路修走上了GEASS之力的诅咒——孤单的王之路。