明朝有一个奥秘的安排——玄衣卫，专门破获各种古怪事件，组员包含苗疆传人、萨满后裔等超自然界高手。故事叙述了玄衣卫被奸人栽赃的几年后，凶恶安排过阴堂日益猖獗，皇城神枢营侍卫数月内多次无故失踪。皇帝大怒，特命玉麒麟彻查办此事。家国安危之下，前玄衣卫指挥使高建斌只身打探，在北镇抚司大战黑衣杀手，更是引出了背后更大的阴谋……