风和日丽的一天，铃木财团巨资营建的铃木塔举行了盛大的开幕典礼。柯南（高山南 配音）和洽朋友们天然受邀观赏。谁知一名游客忽然被远处修建发射来的子弹狙击身亡，柯南确定凶手果断展开追击，然而对方胆大十分，公开炸毁拦截他的警车，在重重包围中脱身而去。在此之后，FBI和日本警方组成联合调查总部，经朱蒂?斯泰琳（一城美由希 配音）介绍得知，嫌疑人很可能是原美国海豹突击队狙击手蒂莫西·亨特。战功显赫的亨特曾经获得过银星勋章，但是后来被战友指控违反交战准则，射杀了手无寸铁的平民，此后他更在战场上遭受影响一生的创痛，人生也完全跌入低谷。此番他以奥秘狙击手的呈现，显然是想想那些消灭了他的人生的人们复仇。 　　狙击事件连续而起，全东京堕入莫大的惊惧之中……