2599年，人类酝酿了五百年之久的火星移民方案总算要迈出重要一步了。在此之前，科学家通过向火星投放藻类以及甲由以改善火星的生存环境。当今，为了防止死刑的赏罚，小町小吉（伊藤英明 饰）和青梅竹马秋田奈奈绪（武井咲 饰）不得不容许本多博士（小栗旬 饰）的要求，与武藤仁（山下智久 饰）、蛭间一郎（山田孝之 饰）、森木明日香（菊地凛子 饰）、堂岛启介（加藤雅也 饰）等有着不同身份和布景的人们踏入前往火星的飞船。抵达意图地后，他们惊奇地发现甲由早已进化成无比健硕巨大的生物，并且敏捷向他们发起了进攻。
　　在战役过程中，他们了解到这次火星旅行的真正意图，所以为了回到地球而拼尽全力与洪水般的甲由人战役…