故事发生在1870年的英国，传闻中海怪的出没的音讯惹得人心惶惶，各国政府都排遣除了军舰在大海上巡逻，哪知道这些军舰均被海怪给击沉了。阿龙纳斯教授（Dan Hanlon 饰）和他的帮手康赛尔成为了海难中的幸存者，一起保住了小命的还有鱼叉手尼德（Curtis Benton 饰），一行人被鹦鹉螺号潜艇救起，他们也就此认识了潜艇的主人尼莫船长。　　尼莫船长久仰阿龙纳斯的大名，把他当做上宾接待。但是船长浮躁的特性和激进的手法让阿龙纳斯明白，此地不宜久留。尼莫船长向阿龙纳斯展现了自己多年来苦心研究的研究成果，亦带他畅游奥秘的海底世界，但阿龙纳斯的脑袋里只有一个念头，那就是逃走。