故事发生在不远的未来，海平面由于不明原因急速上升，大多数地表都沉入了海中。小时候由于事故而失掉一条腿的少年斑鸠夏生，厌恶了都市的日子，移居到了海边的乡村小镇。曾经身为海洋地质学家的祖母留给他的，就只有船、潜水艇和一堆债务。 　　夏生为了取回“失掉的未来”，与迷之索债人凯瑟琳一起，潜海前往据说保存着祖母遗产的海底仓库。在那里，他遇到了一位沉睡在好像棺材一般装置中的不可思议少女“亚托莉”。她是一位构造精密到与人类别无二致，而又有丰富爱情的机器人。从海底被打捞起来的亚托莉如是说到：“我想完成主人留给我的最终的指令。在此之前，我会成为夏生先生的腿！” 　　在一个逐渐沉入海中的平缓小镇，少年和机器人少女的难忘夏日就这么开端了。 　　改编自在Front Wing × 枕发行的同名游戏《ATRI -My Dear Moments-》，近来宣布了将对此进行动画改编