寇克将军，欢迎您重返企业号！　　一团庞然大物的高能离子云，在遥远而奥秘的太空中迅疾地飘移。这团能量云具有无坚不摧的威力，足以消灭国际间任何物质结构。在它所划过的轨迹上，早已有好几艘分属银河三大势力的星舰遇难了……　　地球-银河系星球联邦的重镇，星际舰队总部的所在地。在位于北美洲旧金山的星际联邦舰队总部，寇克将军正像往常相同穷极无聊无所事事，突然间却接到了一个再好不过的指令检视企业号预备履行紧急使命。本来地球的防卫体系己经发现了那团高能离子云，而且侦测出它正对准地球飞来。寇克将军的使命，便是要赶在它抵达地球之前，带领企业号先迎上去一探究竟。　　阔别了将近十年，当寇克重新登上企业号时，心里的振奋与激动真是难以形容。可是当他 随着现任的舰长迪卡审阅过了人员与装备之后，却又不禁兴起不少生疏的感觉。由于经过 这些年来的不断改良，企业号的功能与威力都增强了许多，但也因而使得前任的舰长寇克 将军有点摸不着条理了。　　不过还好的是，接下来立刻就有很大的惊喜减弱了这份生疏感三头六臂的寇克居然在短时间之内简直把老战友都找齐了！破例的只要史波克先生，他由于正在瓦肯星进行高深的修炼，所以没有办法赶来，成了这次使命的唯一遗憾。　　由于寇克是星际舰队的高档长官，所以在动身之后，迪卡舰长只好很不甘愿地暂时交出指挥权。一开端的时候，两位新旧舰长之间难免有些成见与摩擦，但渐渐地就由于相互了解而变得惺惺相惜。寇克发现迪卡的确是个优异称职的好舰长，而迪卡也开端真实地把寇克 敬作世伯。本来迪卡的父亲也曾做过寇克部下，后来却不幸在末日武器那个事情中勇敢牺牲了。　　企业号上的新面孔，除了迪卡舰长之外，还有一位美丽的女领航员伊莉雅。尽管她是德罗坦星人，但除了有头发之外，却是地球人眼中的规范美女，连迪卡舰长都曾与她有过一段罗曼史。　　在迎向能量云的途中，企业号突然发生严重故障，不得不把速度减慢下来。没想到此时史 波克却意外地呈现了，使得所有的老战友全都振奋不已。本来史波克仍是没有经过最终的检测，他体内深藏的人道仍然无法铲除。当史波克面对现实完全想通之后便决议仍是回到星际舰队来持续服役。　　不过，在精通心理学而观察人道的麦考伊眼中，却现已看出了寇克与史波克的杂乱心境。他感觉到他们最关心的好像并不是这次的使命，而是返企业号的成就感。　　由于史波克的高明才能，很快就帮史考特等人排除了全部故障，使得企业号能及时迎上那团能量云。不料正当穿进云层时，伊莉雅却突然被一种不知名的力气掳走，然后却又传送回来了一个与她一模相同的仿制人。据这个仿制的伊莉雅说，她是那团云派来作为双方交流的媒介。本来这团云居然是个有才智的个别！它透过假伊莉雅，声称自己的名字叫『威 者』（V'ger），正要航向地球去寻觅自己的创造者，而且还要企图与创造者结合。接着假伊莉雅又不管世人的疑惑，反而开端询问有关企业号的问题。由于曩昔与伊莉雅的一段根由，迪卡便理所当然地担任与这位假伊莉雅交流，他还不时地使用这种特殊关系，试着向她套取更多威者的情报。　　当这团能量云还剩几个小时就要抵达地球时，史波克擅自偷了一艘小型登陆艇，孤军独战地驶向云层内部，试着用瓦肯人的心灵感应术与它交流。结果史波克发现威者居然是部活机器，它的故乡在银河系的另外一端，是一个悉数由机器人控制的星球。　　尽管威者具有无比强壮的威力，却与人类相同有个一直无法解开的谜-不知道自己的生命从何而来？但史波克不能了解的是，它为什么要到地球去寻觅答案？　　由于无法阻挠威者，企业号只好随着它一同航向地球。抵达地球之后，威者立刻开端用各种讯号呼喊它的创造者，结果当然是得不到回音。但又不知是什么缘故，威者却以为这全 是地球上的『碳基生命』干扰所致，因而决议要把所有的生物悉数消灭！　　好在寇克急中生智，骗假伊莉雅说创造者必须先与威者面对面触摸，然后才肯答复它的问 题。假伊莉雅信以为真，便带领寇克、史波克、麦考伊与迪卡一同走向能量云的核心。没想到却发现里面只要一艘老式的国际飞船在300年前从地球发射的『航海家二号』（Voyager-Ⅱ）。本来它在飞过了那个机器人的国际之后，被改造成一部有才智与认识的机器，然后又持续履行人类在三百年前赋予它的原始指令『搜集全部材料并立刻传回地球』。　　水落石出之后，威者却又提出一个更惊人的要求，它说它想要真实地拥抱自己的创造者-人类。于是迪卡舰长毛遂自荐，在一片奇异耀眼的光辉中，与威者以及仿制的伊莉雅结合成一体。威者交融了迪卡与伊莉雅的人道，变成一种簇新的生命形态，心满意足地离开地球，持续它无尽的国际探险。地球的危机也就此化解。