超级病毒“金美拉”和抗生素在运送途中，被恐怖安排喽罗Sean Ambrose（ Dougray Scott  饰）盗走，Ethan Hunt（Tom Cruise 饰）带领他的IMF小组接受中情局的任务，找回病毒。 　　这次，Ethan Hunt找到了女飞贼Nyah Nordoff-Hall（Thandie Newton  饰）搭档，后者是Sean Ambrose的前女友。Ethan Hunt在获取Nyah信赖的同时，二人也暗生情愫。 　　但是，为了完成任务，Ethan Hunt不得不安排Nyah回到Sean Ambrose身边卧底。 　　Nyah总算打探出病毒所在的药厂，接获情报的Ethan Hunt前往药厂预备销毁病毒；另一边，Sean Ambrose现已发觉出了Nyah回到自己身边的真正意图，安排人马在药厂等候Ethan Hunt自投罗网。 　　激烈的搏斗中，...