神秘工厂深夜突发古怪案子，一名职工古怪惨死，人人都传是不闻名异兽所为，一时间案子变得神乎其神。国际闻名灵异侦探社接到被害人家族的委托，介入此案查询，却被一系列假头绪误导，将凶手锁定在厂长身上，然而厂长在不恰当的时机自杀，使得案情愈加错综杂乱。厂长身后，其女儿光子将侦探社社长何生告上法庭，导致侦探社陷入信誉危机。　　预见到此事的杂乱程度后，何生派出警卫风泽和电脑高手小弥查询涉事工厂，发现厂长死于谋杀，并将查询目标锁定在了工厂的技术顾问长谷川身上。查询证实长谷川的实在身份是日本的通缉犯，而且与流浪汉失踪案有关。与此同时，光子放下了对何生的偏见，与他一起查询案子。　　何生等人深入敌穴，发现工厂的实在面貌是一个大型生物实验室，而且和一个国际组织有牵连，异兽杀人的谜底呼之欲出。可是长谷川在关键时刻叛变，指出幕后主使另有其人。长谷川为何受人指使，终究谁才是唯恐天下不乱的“神秘人”？