人间人多如天上之星，邂逅亦多如天上之星，紧接着的……是离别　　尖锐的警报声忽然响起，通过无线电传入每个人的耳中。八号殖民地“白雪公主”正遭到出人意料的袭击，防护力气正被敏捷瓦解。与此同时，“白雪公主”内部忽然呈现几个头带斗笠象僧侣相同的人开始追杀研究员……当侵略的机器人突入“白雪公主”的时分，里边已经血流成河。那些僧侣们留下一句“你来迟了一步，复仇者，你还未够道行啊”，就神秘的消失了。　　接到求救的联合世界军战舰敏捷赶到，可是“白雪公主”各处已经开始发生爆炸。侵略的机器人留下的唯一踪影是玻色子跳动前的模糊影响，而这种跳动应该是比它大几十倍的大型战舰才能做到了，幽灵机器人的说法因此不径而走。　　由于四个殖民地连续发生爆炸，地球统合军成立意外查询委员会担任查询次事，但他们不信有关机器人玻色子跳动的事情，还把世界军排除在外。为此联合世界军自行打开查询，方案从玻色子跳动体系入手，这就牵涉到葫芦方案。葫芦方案是在人类活动频繁的世界区域内的一些殖民地之间建立玻色子跳动通道，这样拥有次元曲解防壁可以饱尝跳动冲击的战舰就可以通过郁金香便利的来往于各地。按照方案，星野琉璃少校任舰长的机动战舰NADESICO·B受命出发前往葫芦方案的中枢——殖民地“天照”。　　在殖民地“天照”，琉璃受到当地指挥官的故意怠慢，所以她将计就计，表面上接受殖民地组织的所谓“检查”，暗地里使用NADESICO·B里的超级电脑“思兼”侵入“天照”的电脑体系，成果不只发现有葫芦方案正式设计图上没有的玻色子跳动通道，还发现很多非正式的玻色子跳动的人体实验记录。　　正在这个时分，“天照”内的电脑体系呈现反常现象，电子屏幕上充满了OTIKA的字样，无法正常作业。“OTIKA反过来便是AKITO，也便是明人”，忽然想到这点的琉璃似乎预感到什么，“那是暗号，还是偶然？可是那个人……明人和由利加已经死了呀。”　　侵略者总算呈现了，在玻色子的灿烂光辉中。连NADESICO也无法识别的侵略机器人尽管只有十来米长，可是激动性和威力却非常强壮。这时琉璃决断地命令NADESICO进入战备状况但不参加“天照”的捍卫战役，而是静观其变。另一方面，天照出动的是凉子带队的爱特巴里斯队，侵略者似乎抵挡不住迎击而想要撤退，可是谁知这是调虎离山之计。当爱特巴里斯队被引到殖民地外圈的时分，一艘不明战舰忽然通过时空跳动呈现，用重力波炮攻击使殖民地警卫队损毁严峻，侵略机器人也乘乱进入了殖民地内部。　　“你认识的银河明人已经死了，我想你收下他曾生计的证据”星野琉璃，被称为“电子的妖精”的女孩，NADESICO·B的舰长琉璃 超级电脑思兼 NADESICO·C= 无敌　　最后的决斗就在眼前，明人乘坐的黑色机器人蓄势待发　　“他会回来的，如果他不回来，咱们便追上去，由于那个人对咱们很重要”　　这时在殖民地指挥部，一伙自称火星后继者的人发起政变占据了“天照”，而另一方面紧随侵略机器人进到基地内部的凉子在那里见到了前次战役中地球和木星都想得到的火星遗址——玻色子跳动的黑匣子。黑暗中忽然传来一阵摄人心魄的铃声，“危险！”，听到了黑色机器人驾驶员的警告，凉子幸运躲过了狙击。狙击者呈现了，他们便是前次在“白雪公主”大开杀界的那些僧侣，也是火星后继者背面的影子——心黑手辣的暗杀者。僧侣的首领向黑色机器人发话了，“你要死在自己的妻子面前吗”，随着这话音，遗址缓缓打开，呈现在里边的竟然是由利加。原来由利加没有死啊，凉子想，那么明人呢？刚才黑色机器人驾驶员的声音怎样这么耳熟？啊！是明人，他们都还活着！　　混战中凉子被赶来援助的赤月救出，明人和由利加下落不名。“天照”总算被火星后继者给爆破了，之后火星后继者占据了火星极冠，在那里和他们的支持者集结，想要依靠遗址的力气和统合军对抗。　　通过查询，大家得知火星后继者造就和尼鲁加路的竞争对手联合起来，期望通过掌握波色子跳动通道的“葫芦方案”来达到起野心。为此需求那些为数不多的A级跳动者来做玻色子单体跳动的领航员，明人和由利加便是在蜜月旅行的时分被火星后继者绑架了的，当局为了保密才宣称他们不幸遇难。后来明人幸运逃脱了出来，一直在暗中和火星后继者战役。　　面临新的要挟，琉璃等人受命回地球召集人手，已经退役的原NADESICO成员又重新聚集起来，更有不少年轻人加入。但是，到达地球的不只是他们……战役即将爆发，结局到底是什么样的呢？