故事发生在悠远的未来,暴虐的异生兽给人类的安全带来了巨大的困扰,为了抵挡异兽的进攻,日本政府成立了防卫安排TLT,其间,夜袭队拥有着最强大的实力和最微弱的武器,是整个安排内部的中坚力气。 但是,面临经过了进化的新型异生兽,夜袭队亦束手无策,在这个节骨眼上,光之巨人奈克瑟斯奥特曼和它的适能者姫矢准(桐岛优介 饰)出现了。在奈克瑟斯奥特曼创造出的美塔领域中,奥特曼和异兽之间展开了激烈的奋斗。孤门一辉(川久保拓司 饰)是TLT里的新进成员,当他目击了奈克瑟斯奥特曼强大的力气后,开始对奥特曼的来源和姬矢准的奥秘过往产生了兴趣。