时为公元2202年。　　自从世界战舰大和号从那场单程长达16万8000光年、通往伊斯坎达尔的强大帆海中回归以来，现已过了3年——。　　在“世界康复系统”之下取回先前蓝色样貌的地球，　　与卡米拉斯帝国缔结了平和公约。　　在复兴的同时，为了防卫而进行的包括最新锐战舰安德洛墨达在内的新锐舰队的整备工作也在推动中。　　伊斯坎达尔的丝塔夏的愿望也化为乌有，地球开端迈向扩军之道。　　这真的是在无可替代的大都献身之后，大和所达到的真正的平和吗？　　期盼世界平稳的女神特蕾莎的祈愿，将大和邀往新的帆海。　　现在，席卷世界的加特兰蒂斯的威胁，正在逼近地球——。