刚刚完毕了与叛忍集团“晓”的反抗，木叶村被一股怪异不祥的气氛所笼罩。此时此刻，漩涡鸣人（竹内顺子 配音）沉浸在对家人的怀念中，孤单无助。某个晚上，心情糟糕的鸣人巧遇刚刚和家人吵架的小樱（中村千绘 配音），二人在公园闲谈之际，奥秘的斑（内田直哉 配音）突然出现，并向二人使出瞳术。晕厥往后，鸣人和小樱发现看似一如往常的木叶村，曾经了解的同伴竟然性情发生巨变。一连串不正常的事件令二人苦恼不已。更令人难以置信的是，包括佐助以及鸣人的父母波风水门（森川智之 配音）和玖辛奈（篠原惠美 配音）也出现在他们的面前。斑的阴谋慢慢打开…… 　　本片根据岸本齐史的漫画原作改编，为该作品第九部动画剧场版。