本片讲述的是蝙蝠侠（罗杰·克雷格·史密斯 配音）以及罗宾联合正义联盟成员闪电侠以及绿箭侠一同对立被称为Animilitia的违法安排。该违法安排都是由一些动物性的成员组成，包括银背大猩猩、猎豹女、杀手鳄鱼等，他们在高谭市作恶多端，一般差人对他们束手无策。并且该安排背面的主谋却指向蝙蝠侠的宿敌，同时也是高谭市叱吒风云的黑道大亨企鹅人（Dana Snyder 配音）。除了Animilitia安排，蝙蝠侠他们这次还要面临奥斯瓦德公司的商人新发明的邪恶网络动物机器人，一群违法恶势力再次集合在高谭市。