寇克将军，欢迎您重返企业号！　　一团庞然大物的高能离子云，在悠远而神秘的太空中迅疾地飘移。这团能量云具有无坚不摧的威力，足以毁灭国际间任何物质结构。在它所划过的轨迹上，早已有好几艘分属银河三大实力的星舰遇难了……　　地球-银河系星球联邦的重镇，星际舰队总部的所在地。在位于北美洲旧金山的星际联邦舰队总部，寇克将军正像往常相同百无聊赖无所事事，忽然间却接到了一个再好不过的指令检视企业号预备履行紧急使命。本来地球的防卫系统己经发现了那团高能离子云，而且侦测出它正对准地球飞来。寇克将军的使命，就是要赶在它抵达地球之前，带领企业号先迎上去一探终究。　　阔别了将近十年，当寇克从头登上企业号时，心里的兴奋与激动真是难以形容。但是当他 跟着现任的舰长迪卡审阅过了人员与装备之后，却又不由鼓起不少生疏的感觉。由于通过 这些年来的不断改良，企业号的功能与威力都增强了许多，但也因此使得上一任的舰长寇克 将军有点摸不着条理了。　　不过还好的是，接下来马上就有很大的惊喜减弱了这份生疏感三头六臂的寇克竟然在短时间之内几乎把老战友都找齐了！例外的只有史波克先生，他由于正在瓦肯星进行高深的修炼，所以没有办法赶来，成了这次使命的唯一遗憾。　　由于寇克是星际舰队的高档长官，所以在动身之后，迪卡舰长只好很不情愿地暂时交出指挥权。一开始的时分，两位新旧舰长之间不免有些成见与冲突，但渐渐地就由于相互了解而变得志同道合。寇克发现迪卡的确是个优秀胜任的好舰长，而迪卡也开始真实地把寇克 敬作父执。本来迪卡的父亲也曾做过寇克部下，后来却不幸在末日武器那个事情中英勇牺牲了。　　企业号上的新面孔，除了迪卡舰长之外，还有一位美丽的女领航员伊莉雅。虽然她是德罗坦星人，但除了有头发之外，却是地球人眼中的规范美人，连迪卡舰长都曾与她有过一段罗曼史。　　在迎向能量云的途中，企业号忽然产生严峻毛病，不得不把速度减慢下来。没想到此刻史 波克却意外地呈现了，使得悉数的老战友全都兴奋不已。本来史波克还是没有通过最后的检测，他体内深藏的人性仍然无法根除。当史波克面对现实彻底想通之后便决议还是回到星际舰队来持续执役。　　不过，在通晓心理学而洞悉人性的麦考伊眼中，却已经看出了寇克与史波克的杂乱心情。他感觉到他们最关心的好像并不是这次的使命，而是返企业号的成就感。　　由于史波克的高超能力，很快就帮史考特等人排除了悉数毛病，使得企业号能及时迎上那团能量云。不料合理穿进云层时，伊莉雅却忽然被一种不知名的力量掳走，然后却又传送回来了一个与她一模相同的仿制人。据这个仿制的伊莉雅说，她是那团云派来作为两边交流的媒介。本来这团云竟然是个有才智的个体！它透过假伊莉雅，宣称自己的名字叫『威 者』（V'ger），正要航向地球去寻觅自己的创造者，而且还要试图与创造者结合。接着假伊莉雅又不管众人的疑惑，反而开始问询有关企业号的问题。由于过去与伊莉雅的一段根由，迪卡便理所当然地负责与这位假伊莉雅交流，他还不时地利用这种特殊关系，试着向她套取更多威者的情报。　　当这团能量云还剩几个小时就要抵达地球时，史波克私行偷了一艘小型登陆艇，单枪匹马地驶向云层内部，试着用瓦肯人的心灵感应术与它交流。成果史波克发现威者竟然是部活机器，它的故乡在银河系的另外一端，是一个悉数由机器人统治的星球。　　虽然威者具有无比强大的威力，却与人类相同有个始终无法解开的谜-不知道自己的生命从何而来？但史波克不能了解的是，它为什么要到地球去寻觅答案？　　由于无法阻挠威者，企业号只好跟着它一起航向地球。抵达地球之后，威者马上开始用各种讯号呼唤它的创造者，成果当然是得不到回音。但又不知是什么缘故，威者却认为这全 是地球上的『碳基生命』干扰所造成的，因此决议要把悉数的生物悉数消除！　　好在寇克急中生智，骗假伊莉雅说创造者必须先与威者面对面接触，然后才肯回答它的问 题。假伊莉雅信以为真，便带领寇克、史波克、麦考伊与迪卡一起走向能量云的核心。没想到却发现里面只有一艘老式的国际飞船在300年前从地球发射的『航海家二号』（Voyager-Ⅱ）。本来它在飞过了那个机器人的国际之后，被改造成一部有才智与认识的机器，然后又持续履行人类在三百年前赋予它的原始指令『搜集悉数材料并马上传回地球』。　　真相大白之后，威者却又提出一个更惊人的要求，它说它想要真实地拥抱自己的创造者-人类。所以迪卡舰长自告奋勇，在一片奇异耀眼的光辉中，与威者以及仿制的伊莉雅结组成一体。威者交融了迪卡与伊莉雅的人性，变成一种崭新的生命形状，心满意足地脱离地球，持续它无尽的国际探险。地球的危机也就此化解。